Jósvafőn született 1828. január 17-én. Elemi iskoláit édesatyja, Kis Dániel jósvafői tanító vezetése alatt végezte. 1837-ben a miskolci református gimnáziumba lépett, ahol négy évig tanult. Édesapja 1838-ban meghalt, ettől kezdve özvegy édesanyja, Dely Mária nevelte. Kis Bálint Losoncon végezte tanulmányait 6 éven át, eközben tanítóskodott Hetényben és Alsó-Némediben, hogy eltarthassa magát. Később Debrecenbe ment tanulni. Az 1848-49-es szabadságharcban honvédként harcolt. A világosi fegyverletétel után Debrecenben folytatta tanulmányait.
1851-ben itt érte a gyomai református egyház meghívása felsőbb fiúosztály tanítói állásra. 1863-ig a IV-V-VI., 1863-1885-ig pedig az V. és VI. fiúosztály tanítója volt.
1885-ben gyakori betegeskedései miatt megvált állásától, és ebből az alkalomból érdemei elismeréséül a gyomai református egyház örökös presbiterré választotta. Nagy tudását bizonyítja a debreceni főiskola oktatókarának bizonyító levele, amelyből megtudhatjuk, hogy "dicséretes szorgalommal végezte a következő tudományokat, melyeket tanulni tartozott: magyar, német, latin, hellén, héber, nyelvészet, ó-közép, újabb és honi történettant, tiszta és alkalmazott mértant, természet, vegy- és ásványtant, észjogot, országlástant, egyetemes és honi jelenrajzot, jogtant, Szentirat magyarázási szabályokat, egyháztörténetet, gyakorlati lelkészettant."
Kis Bálint 36 évig nevelt és tanított céltudatosan, kb. 1500 tanítványa szerette és tisztelte őt. Egyike volt azoknak, akik a modern pedagógia elveit elfogadta. Az értelem fejlesztésére helyezte a fő hangsúlyt, nem volt híve a könyv nélküli magoltatásnak. Ahol lehetett, szemléltetett; gyakran ő maga készítette a szükséges eszközöket. Tanítványait az olvasás szeretetére, az erkölcsös életre nevelte. Garzó Gyula akkori lelkipásztorban kiváló munkatársra talált.
A gyomai reformátusság egyházi, iskolai, kulturális felemelkedésének virágkorát élte tevékenységük idején. Kis Bálint nem alapított családot, de magához vette szegénységben élő rokonait, és gondoskodott róluk. Az iskola volt az ő otthona, akkor volt boldog, ha tanítványai között lehetett.
